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Los polipéptidos son moléculas grandes, y cada secuencia de polipéptidos tiene sus propias propiedades físicas y químicas. Algunos polipéptidos son difíciles de sintetizar, otros son relativamente fáciles de sintetizar, pero la purificación es difícil, es principalmente insolúcible en agua, por lo que en la purificación, esos péptidos hidrofóbicos deben disolverse en disolventes no acuáticos o amortiguadores especiales, sin embargo, estos disolventes o amortiguadores pueden no ser adecuados para la aplicación en sistemas experimentales biológicos, y los investigadores no pueden usar este Péptido para fines de Investigación.
Los sintéticos de boassen ofrecen algunos consejos para el diseño de péptidos de los investigadores después de años de exploración y acumulación:
Se vuelve difícil y fácil
1. el aumento de la longitud de los péptidos que reducen la longitud de la secuencia conduce a una disminución de la pureza de los productos gruesos, y los péptidos con menos de 15 residuos son más fáciles de obtener. Cuando las cadenas de péptidos aumentan a más de 20, se debe considerar la cantidad de productos normales. En la práctica específica, los residuos inferiores a 20 a menudo pueden obtener mejores resultados.
2. reducir los péptidos en los que los residuos hidrofóbicos tienen una clara ventaja, especialmente en las áreas a 7 - 12 residuos del extremo c, puede causar dificultades de síntesis, generalmente se cree que debido a la formación de tabletas plegables beta en la síntesis, se produce un desajuste. Por supuesto, puede ser útil reemplazar varios residuos polares o agregar Gly o pro para abrir fácilmente la estructura del péptido.
3. hay varios residuos cys, met, ARG y try que son generalmente difíciles de sintetizar para reducir los residuos "difíciles". Ser suele ser reemplazable como no oxidativo.
Mejorar la solubilidad
1. Proponemos cambiar el péptido ácido N O C - Terminal (con carga negativa a las 7 en ph); El extremo n se acetila en el extremo C para mantener el Grupo carboxílico libre para aumentar la carga negativa. El péptido alcalino (con carga positiva a las 7: 00 de ph) se aminoácidos libres en el segmento n del extremo C para aumentar la carga positiva.
2. acortar o alargar secuencias algunas secuencias contienen una gran cantidad de aminoácidos hidrofóbicos, como trp, phe, val, ile, leu, met,
Tyr, ala, etc., suelen ser difíciles de disolver cuando estos residuos hidrofóbicos son superiores al 50%. Para aumentar la polaridad de los péptidos, alargar la secuencia puede ayudar. Otra opción es reducir la longitud de la cadena de péptidos para aumentar la polaridad reduciendo los residuos hidrofóbicos. Cuanto mayor sea la polar de la cadena de péptidos, más probable será que se disuelva en agua.
3. la adición de residuos solubles puede mejorar la solubilidad de algunos aminoácidos polares. Los péptidos ácidos se pueden agregar en el extremo N O C
Glu - glu. los péptidos alcalinos se pueden agregar Lys - Lys en el extremo n o C. si no se puede agregar el Grupo cargado. Se puede agregar ser - Gly - Zero al extremo n o C. Sin embargo, este método no funciona cuando los extremos de la cadena péptida no se pueden cambiar.
4. cambiar la solubilidad de la cadena de péptidos de la secuencia mediante el reemplazo de uno o más residuos puede mejorar cambiando algunos residuos de la secuencia, y generalmente el reemplazo de un solo residuo puede cambiar significativamente su hidrofobicidad. Y este cambio es más conservador, como reemplazar a ala por gly.
5. la selección de diferentes "marcos" para cambiar la secuencia puede lograr el propósito de cambiar la secuencia cambiando el punto de partida de varios polipéptidos si se pueden preparar muchos polipéptidos con cierta longitud conectados o superpuestos entre sí con una determinada secuencia. El principio es crear un nuevo y mejor equilibrio entre los residuos hidrofílicos e hidrofóbicos del mismo polipéptidos, o poner los residuos "difíciles" del mismo polipéptidos (como poner dos cys) en dos polipéptidos diferentes en lugar de agruparlos en la misma molécula.
Beijing boason Biotechnology co., Ltd. - Sala de síntesis de péptidos
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